| Mannschaften | Erg. | Zus. | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 08.02.2009 21. Spieltag | |||||
| SpVgg Unterhaching SC Paderborn 07 |
2:1 | 0 | |||
| 03.03.2009 21. Spieltag | |||||
| SV Sandhausen SV Werder Bremen II |
3:1 | 0 | |||
| 08.02.2009 21. Spieltag | |||||
| SSV Jahn Regensburg VfR Aalen |
1:0 | 0 | |||
| 07.02.2009 21. Spieltag | |||||
| BSV Kickers Emden SG Dynamo Dresden |
2:2 | 0 | |||
| 15.04.2009 21. Spieltag | |||||
| FC Bayern München II Wuppertaler SV Borussia |
2:0 | 0 | |||
| 07.02.2009 21. Spieltag | |||||
| VfB Stuttgart II 1. FC Union Berlin |
0:3 | 0 | |||
| 10.03.2009 21. Spieltag | |||||
| SV Wacker Burghausen Offenbacher FC Kickers |
0:0 | 0 | |||
| 05.02.2009 21. Spieltag | |||||
| Fortuna Düsseldorf SV Stuttgarter Kickers |
2:0 | 0 | |||
| 04.03.2009 21. Spieltag | |||||
| FC Erzgebirge Aue FC Carl Zeiss Jena |
5:0 | 10.200 | |||
| FC Rot-Weiß Erfurt BTSV Eintracht Braunschweig |
2:1 | 0 | |||
| Pl. | Verein | Sp. | Gew. | Un. | Ver. | Pkt. | Tore | +/- |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | 1. FC Union Berlin | 21 | 12 | 7 | 2 | 43 | 36:15 | 21 |
| 2. | SC Paderborn 07 | 21 | 13 | 3 | 5 | 42 | 39:23 | 16 |
| 3. | BSV Kickers Emden | 21 | 11 | 6 | 4 | 39 | 29:19 | 10 |
| 4. | Fortuna Düsseldorf | 21 | 11 | 4 | 6 | 37 | 30:16 | 14 |
| 5. | SpVgg Unterhaching | 21 | 10 | 5 | 6 | 35 | 28:28 | 0 |
| 6. | FC Rot-Weiß Erfurt | 21 | 10 | 4 | 7 | 34 | 30:22 | 8 |
| 7. | Offenbacher FC Kickers | 21 | 8 | 9 | 4 | 33 | 27:19 | 8 |
| 8. | FC Bayern München II | 21 | 7 | 12 | 2 | 33 | 26:20 | 6 |
| 9. | SV Sandhausen | 21 | 7 | 7 | 7 | 28 | 32:29 | 3 |
| 10. | VfB Stuttgart II | 21 | 7 | 6 | 8 | 27 | 35:29 | 6 |
| 11. | FC Erzgebirge Aue | 21 | 7 | 6 | 8 | 27 | 30:29 | 1 |
| 12. | FC Carl Zeiss Jena | 21 | 6 | 7 | 8 | 25 | 24:33 | -9 |
| 13. | BTSV Eintracht Braunschweig | 21 | 6 | 6 | 9 | 24 | 25:26 | -1 |
| 14. | VfR Aalen | 21 | 4 | 11 | 6 | 23 | 17:25 | -8 |
| 15. | SSV Jahn Regensburg | 21 | 5 | 8 | 8 | 23 | 20:30 | -10 |
| 16. | SG Dynamo Dresden | 21 | 5 | 7 | 9 | 22 | 19:25 | -6 |
| 17. | SV Wacker Burghausen | 21 | 5 | 6 | 10 | 21 | 24:38 | -14 |
| 18. | Wuppertaler SV Borussia | 21 | 4 | 6 | 11 | 18 | 19:33 | -14 |
| 19. | SV Werder Bremen II | 21 | 4 | 4 | 13 | 16 | 27:38 | -11 |
| 20. | SV Stuttgarter Kickers | 21 | 2 | 8 | 11 | 11 | 24:44 | -20 |